根据Edward Snowden向《卫报》提供的美国国家安全局（NSA）机密文件，
微软公司在拦截用户信息方面与NSA密切合作，包括帮助NSA绕过它自己的加密系统。
机密文档显示，微软与FBI合作提供解决方案帮助NSA绕过新Outlook.com
web聊天的加密；NSA能在加密之前阶段访问Outlook.com包括Hotmail的邮件；微软与FBI协作允许NSA更容易的访问其云储存服务SkyDrive；在微软收购Skype之后9个月，NSA吹嘘通过Prism计划它收集的Skype视频呼叫数量翻了三番。
微软仍然否认提供后门，称只根据法庭命令向政府提供用户数据。
Skype在2010年11月整合到了Prism计划中，NSA声称收集到Skype呼叫非常清晰，元数据（即时间和呼叫对象）非常完整
